员工旷工三天自动离职后，工资处理还可能受特殊情况影响：
1. 若用人单位规章制度明确合法，且已公示告知“旷工三天自动离职不支付工资”，虽程序合法且员工知晓，也不能完全不支付已工作工资，仅可依规合理处理。
2. 若劳动合同约定旷工三天自动离职不支付工资且员工自愿同意，此类约定因违反《劳动合同法》等法律规定无效，员工仍有权获已工作工资，但处理可能较复杂。
3. 若员工因不可抗力（如突发疾病住院无法及时请假）等正当理由旷工，用人单位不能简单认定为自动离职，工资应正常支付并保障权益。
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员工旷工三天自动离职后，工资方面存在法律风险：
1. 工资被克扣或拖欠风险：部分单位可能以“旷工造成损失”为由克扣/拖欠工资，例如某员工工作20天旷工3天离职，单位拒付全部工资，侵犯合法权益。
2. 证据不足维权困难：若未保留考勤记录、工资条等证据，单位否认出勤天数或工资标准时，员工可能因举证不足无法顺利索要工资。
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处理员工旷工三天自动离职的工资问题，需避免以下错误操作：
1. 自行放弃工资：员工提供劳动即有权获工资，放弃维权会损害合法权益。
2. 采取过激行为：索要工资无果时采取堵门、闹事等行为，不仅无效，还可能违反治安管理规定并承担法律责任。
3. 不重视证据保存：未及时收集劳动合同、考勤记录等证据，维权时难以证明工作情况和工资标准。
若已出现上述情况或对维权存疑，欢迎咨询我为您解答。
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从法律依据分析员工旷工三天自动离职是否有工资：
《中华人民共和国劳动合同法》（2012年修正版）第三十条规定：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令。”
《工资支付暂行规定》第九条明确：“劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。”
员工旷工三天自动离职，但其已提供劳动，用人单位应按约定和规定支付已工作期间工资。

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